Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
LMNB1P20700 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMNB1P20700 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMNB1P20700 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMNB1P20700 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMNB1P20700 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMNB1P20700 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMNB1P20700 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMNB1P20700 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMNB1P20700 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMNB1P20700 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMNB1P20700 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMNB1P20700 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMNB1P20700 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMNB1P20700 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LMNB1P20700 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LMNB1P20700 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LMNB1P20700 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LMNB1P20700 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
LMNB1P20700 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LMNB1P20700 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LMNB1P20700 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LMNB1P20700 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LMNB1P20700 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMNB1P20700 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
LMNB1P20700 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMNB1P20700 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMNB1P20700 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMNB1P20700 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMNB1P20700 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
LMNB1P20700 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
LMNB1P20700 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms