Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB5AP20339 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB5AP20339 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RAB5AP20339 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms