Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB6P18564 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB6P18564 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB6P18564 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms