Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GM2AP17900 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GM2AP17900 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GM2AP17900 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GM2AP17900 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GM2AP17900 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GM2AP17900 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GM2AP17900 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GM2AP17900 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GM2AP17900 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GM2AP17900 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GM2AP17900 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
GM2AP17900 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GM2AP17900 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GM2AP17900 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GM2AP17900 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GM2AP17900 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GM2AP17900 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GM2AP17900 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GM2AP17900 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GM2AP17900 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GM2AP17900 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GM2AP17900 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GM2AP17900 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GM2AP17900 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GM2AP17900 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GM2AP17900 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GM2AP17900 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GM2AP17900 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GM2AP17900 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GM2AP17900 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GM2AP17900 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GM2AP17900 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GM2AP17900 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GM2AP17900 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GM2AP17900 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GM2AP17900 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GM2AP17900 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GM2AP17900 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GM2AP17900 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GM2AP17900 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GM2AP17900 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GM2AP17900 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GM2AP17900 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GM2AP17900 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GM2AP17900 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GM2AP17900 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GM2AP17900 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GM2AP17900 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GM2AP17900 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GM2AP17900 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GM2AP17900 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GM2AP17900 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GM2AP17900 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GM2AP17900 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GM2AP17900 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GM2AP17900 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GM2AP17900 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GM2AP17900 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GM2AP17900 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GM2AP17900 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GM2AP17900 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GM2AP17900 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GM2AP17900 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GM2AP17900 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GM2AP17900 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GM2AP17900 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GM2AP17900 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GM2AP17900 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GM2AP17900 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GM2AP17900 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GM2AP17900 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GM2AP17900 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GM2AP17900 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GM2AP17900 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GM2AP17900 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GM2AP17900 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GM2AP17900 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GM2AP17900 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GM2AP17900 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GM2AP17900 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GM2AP17900 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GM2AP17900 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GM2AP17900 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GM2AP17900 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GM2AP17900 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GM2AP17900 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GM2AP17900 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GM2AP17900 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GM2AP17900 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GM2AP17900 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GM2AP17900 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GM2AP17900 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GM2AP17900 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GM2AP17900 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GM2AP17900 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GM2AP17900 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GM2AP17900 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GM2AP17900 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GM2AP17900 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms