Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKMT2P17540 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKMT2P17540 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKMT2P17540 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CKMT2P17540 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKMT2P17540 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKMT2P17540 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKMT2P17540 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms