Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCAP17252 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCAP17252 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCAP17252 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCAP17252 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCAP17252 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCAP17252 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCAP17252 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCAP17252 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCAP17252 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCAP17252 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRKCAP17252 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCAP17252 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCAP17252 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCAP17252 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms