Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MUC1P15941 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MUC1P15941 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MUC1P15941 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MUC1P15941 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MUC1P15941 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MUC1P15941 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MUC1P15941 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MUC1P15941 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC1P15941 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC1P15941 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC1P15941 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC1P15941 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC1P15941 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC1P15941 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC1P15941 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC1P15941 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC1P15941 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC1P15941 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC1P15941 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC1P15941 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC1P15941 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC1P15941 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC1P15941 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC1P15941 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC1P15941 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC1P15941 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC1P15941 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC1P15941 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC1P15941 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC1P15941 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC1P15941 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC1P15941 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC1P15941 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC1P15941 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MUC1P15941 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC1P15941 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC1P15941 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC1P15941 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC1P15941 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC1P15941 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC1P15941 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC1P15941 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC1P15941 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC1P15941 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC1P15941 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC1P15941 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC1P15941 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MUC1P15941 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MUC1P15941 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MUC1P15941 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MUC1P15941 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MUC1P15941 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MUC1P15941 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MUC1P15941 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MUC1P15941 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MUC1P15941 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MUC1P15941 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MUC1P15941 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC1P15941 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC1P15941 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC1P15941 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC1P15941 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC1P15941 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC1P15941 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC1P15941 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC1P15941 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC1P15941 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC1P15941 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC1P15941 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC1P15941 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC1P15941 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC1P15941 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC1P15941 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC1P15941 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC1P15941 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC1P15941 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC1P15941 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MUC1P15941 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC1P15941 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC1P15941 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC1P15941 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC1P15941 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC1P15941 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC1P15941 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC1P15941 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC1P15941 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC1P15941 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC1P15941 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC1P15941 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC1P15941 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC1P15941 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC1P15941 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MUC1P15941 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MUC1P15941 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MUC1P15941 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MUC1P15941 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MUC1P15941 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MUC1P15941 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MUC1P15941 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms