Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSPP15924 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSPP15924 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSPP15924 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSPP15924 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSPP15924 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSPP15924 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSPP15924 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSPP15924 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSPP15924 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSPP15924 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSPP15924 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSPP15924 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSPP15924 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSPP15924 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSPP15924 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSPP15924 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSPP15924 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSPP15924 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSPP15924 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSPP15924 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSPP15924 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSPP15924 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSPP15924 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DSPP15924 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSPP15924 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSPP15924 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSPP15924 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSPP15924 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSPP15924 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSPP15924 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSPP15924 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSPP15924 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DSPP15924 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSPP15924 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSPP15924 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSPP15924 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSPP15924 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSPP15924 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DSPP15924 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSPP15924 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSPP15924 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSPP15924 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSPP15924 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSPP15924 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSPP15924 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DSPP15924 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSPP15924 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSPP15924 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSPP15924 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSPP15924 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DSPP15924 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSPP15924 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSPP15924 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSPP15924 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSPP15924 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSPP15924 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSPP15924 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSPP15924 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSPP15924 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSPP15924 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSPP15924 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSPP15924 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSPP15924 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSPP15924 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSPP15924 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSPP15924 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSPP15924 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSPP15924 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSPP15924 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSPP15924 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSPP15924 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSPP15924 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSPP15924 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSPP15924 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSPP15924 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSPP15924 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSPP15924 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSPP15924 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSPP15924 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSPP15924 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSPP15924 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSPP15924 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSPP15924 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSPP15924 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSPP15924 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSPP15924 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSPP15924 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSPP15924 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSPP15924 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DSPP15924 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DSPP15924 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSPP15924 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSPP15924 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSPP15924 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSPP15924 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSPP15924 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSPP15924 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSPP15924 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSPP15924 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms