Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLS3P13797 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLS3P13797 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLS3P13797 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLS3P13797 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLS3P13797 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLS3P13797 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLS3P13797 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLS3P13797 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLS3P13797 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLS3P13797 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLS3P13797 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLS3P13797 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLS3P13797 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLS3P13797 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLS3P13797 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLS3P13797 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PLS3P13797 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLS3P13797 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLS3P13797 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLS3P13797 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLS3P13797 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLS3P13797 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLS3P13797 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLS3P13797 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLS3P13797 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLS3P13797 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLS3P13797 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLS3P13797 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLS3P13797 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLS3P13797 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLS3P13797 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLS3P13797 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLS3P13797 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLS3P13797 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLS3P13797 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLS3P13797 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLS3P13797 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLS3P13797 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLS3P13797 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLS3P13797 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLS3P13797 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLS3P13797 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLS3P13797 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLS3P13797 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLS3P13797 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PLS3P13797 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLS3P13797 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLS3P13797 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLS3P13797 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLS3P13797 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLS3P13797 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLS3P13797 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLS3P13797 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLS3P13797 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLS3P13797 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLS3P13797 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLS3P13797 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLS3P13797 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PLS3P13797 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLS3P13797 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PLS3P13797 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PLS3P13797 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PLS3P13797 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PLS3P13797 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PLS3P13797 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PLS3P13797 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PLS3P13797 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PLS3P13797 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLS3P13797 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLS3P13797 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLS3P13797 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLS3P13797 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLS3P13797 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLS3P13797 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLS3P13797 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLS3P13797 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLS3P13797 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLS3P13797 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLS3P13797 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLS3P13797 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLS3P13797 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLS3P13797 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLS3P13797 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLS3P13797 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLS3P13797 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLS3P13797 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLS3P13797 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLS3P13797 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLS3P13797 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLS3P13797 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLS3P13797 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLS3P13797 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLS3P13797 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLS3P13797 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLS3P13797 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLS3P13797 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLS3P13797 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLS3P13797 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLS3P13797 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms