Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYL4P12829 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYL4P12829 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYL4P12829 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYL4P12829 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYL4P12829 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYL4P12829 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYL4P12829 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYL4P12829 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYL4P12829 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MYL4P12829 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYL4P12829 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYL4P12829 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYL4P12829 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYL4P12829 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYL4P12829 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYL4P12829 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYL4P12829 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYL4P12829 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYL4P12829 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYL4P12829 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYL4P12829 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYL4P12829 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYL4P12829 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYL4P12829 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYL4P12829 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYL4P12829 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYL4P12829 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYL4P12829 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYL4P12829 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYL4P12829 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYL4P12829 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYL4P12829 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYL4P12829 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MYL4P12829 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYL4P12829 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MYL4P12829 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYL4P12829 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYL4P12829 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYL4P12829 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYL4P12829 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYL4P12829 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYL4P12829 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYL4P12829 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYL4P12829 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYL4P12829 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYL4P12829 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MYL4P12829 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYL4P12829 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYL4P12829 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYL4P12829 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYL4P12829 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MYL4P12829 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MYL4P12829 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYL4P12829 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYL4P12829 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYL4P12829 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYL4P12829 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYL4P12829 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYL4P12829 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYL4P12829 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYL4P12829 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYL4P12829 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYL4P12829 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
MYL4P12829 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MYL4P12829 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYL4P12829 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYL4P12829 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYL4P12829 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYL4P12829 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYL4P12829 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYL4P12829 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MYL4P12829 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYL4P12829 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYL4P12829 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYL4P12829 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYL4P12829 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYL4P12829 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYL4P12829 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYL4P12829 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYL4P12829 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYL4P12829 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYL4P12829 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYL4P12829 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MYL4P12829 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MYL4P12829 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYL4P12829 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYL4P12829 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYL4P12829 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYL4P12829 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYL4P12829 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYL4P12829 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYL4P12829 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYL4P12829 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYL4P12829 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYL4P12829 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYL4P12829 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYL4P12829 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MYL4P12829 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYL4P12829 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.4 ms