Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DMDP11532 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DMDP11532 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DMDP11532 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DMDP11532 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DMDP11532 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DMDP11532 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DMDP11532 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DMDP11532 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DMDP11532 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DMDP11532 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DMDP11532 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DMDP11532 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DMDP11532 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DMDP11532 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DMDP11532 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DMDP11532 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DMDP11532 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DMDP11532 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DMDP11532 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DMDP11532 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DMDP11532 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DMDP11532 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DMDP11532 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DMDP11532 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DMDP11532 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DMDP11532 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DMDP11532 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DMDP11532 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DMDP11532 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DMDP11532 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DMDP11532 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DMDP11532 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DMDP11532 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DMDP11532 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DMDP11532 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DMDP11532 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DMDP11532 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DMDP11532 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DMDP11532 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DMDP11532 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DMDP11532 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DMDP11532 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DMDP11532 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DMDP11532 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DMDP11532 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DMDP11532 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DMDP11532 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DMDP11532 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DMDP11532 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DMDP11532 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DMDP11532 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DMDP11532 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DMDP11532 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DMDP11532 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DMDP11532 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DMDP11532 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DMDP11532 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DMDP11532 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DMDP11532 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DMDP11532 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DMDP11532 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DMDP11532 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DMDP11532 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DMDP11532 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DMDP11532 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DMDP11532 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DMDP11532 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DMDP11532 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DMDP11532 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DMDP11532 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DMDP11532 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DMDP11532 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DMDP11532 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DMDP11532 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DMDP11532 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DMDP11532 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DMDP11532 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DMDP11532 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DMDP11532 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DMDP11532 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DMDP11532 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DMDP11532 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DMDP11532 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DMDP11532 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DMDP11532 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DMDP11532 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DMDP11532 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DMDP11532 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DMDP11532 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DMDP11532 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DMDP11532 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DMDP11532 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DMDP11532 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DMDP11532 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DMDP11532 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DMDP11532 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DMDP11532 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DMDP11532 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DMDP11532 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms