Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GZMBP10144 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GZMBP10144 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GZMBP10144 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GZMBP10144 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GZMBP10144 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GZMBP10144 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GZMBP10144 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GZMBP10144 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GZMBP10144 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GZMBP10144 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GZMBP10144 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GZMBP10144 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GZMBP10144 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GZMBP10144 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GZMBP10144 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GZMBP10144 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GZMBP10144 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GZMBP10144 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GZMBP10144 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GZMBP10144 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GZMBP10144 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GZMBP10144 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GZMBP10144 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GZMBP10144 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GZMBP10144 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GZMBP10144 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GZMBP10144 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GZMBP10144 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GZMBP10144 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GZMBP10144 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GZMBP10144 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GZMBP10144 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GZMBP10144 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GZMBP10144 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GZMBP10144 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GZMBP10144 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GZMBP10144 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GZMBP10144 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GZMBP10144 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GZMBP10144 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GZMBP10144 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GZMBP10144 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GZMBP10144 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GZMBP10144 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GZMBP10144 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GZMBP10144 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GZMBP10144 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GZMBP10144 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GZMBP10144 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GZMBP10144 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GZMBP10144 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GZMBP10144 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GZMBP10144 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GZMBP10144 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GZMBP10144 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GZMBP10144 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GZMBP10144 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GZMBP10144 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GZMBP10144 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GZMBP10144 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GZMBP10144 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GZMBP10144 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GZMBP10144 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GZMBP10144 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GZMBP10144 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GZMBP10144 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GZMBP10144 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GZMBP10144 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GZMBP10144 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GZMBP10144 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GZMBP10144 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GZMBP10144 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GZMBP10144 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GZMBP10144 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GZMBP10144 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GZMBP10144 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GZMBP10144 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GZMBP10144 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GZMBP10144 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GZMBP10144 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GZMBP10144 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GZMBP10144 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GZMBP10144 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GZMBP10144 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GZMBP10144 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GZMBP10144 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GZMBP10144 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GZMBP10144 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GZMBP10144 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GZMBP10144 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GZMBP10144 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GZMBP10144 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GZMBP10144 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GZMBP10144 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GZMBP10144 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GZMBP10144 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GZMBP10144 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GZMBP10144 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GZMBP10144 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms