Protein–RNA interactions for Protein: P05387

RPLP2, 60S acidic ribosomal protein P2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP2P05387 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPLP2P05387 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPLP2P05387 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPLP2P05387 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPLP2P05387 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RPLP2P05387 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPLP2P05387 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPLP2P05387 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPLP2P05387 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPLP2P05387 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPLP2P05387 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPLP2P05387 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPLP2P05387 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RPLP2P05387 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPLP2P05387 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPLP2P05387 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms