Protein–RNA interactions for Protein: P04114

APOB, Apolipoprotein B-100, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBP04114 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBP04114 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBP04114 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBP04114 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBP04114 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBP04114 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBP04114 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBP04114 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBP04114 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBP04114 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBP04114 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBP04114 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBP04114 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBP04114 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBP04114 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBP04114 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBP04114 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBP04114 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBP04114 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBP04114 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBP04114 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBP04114 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBP04114 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBP04114 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBP04114 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBP04114 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBP04114 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBP04114 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBP04114 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBP04114 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBP04114 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBP04114 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBP04114 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBP04114 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBP04114 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBP04114 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBP04114 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBP04114 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBP04114 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBP04114 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBP04114 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBP04114 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBP04114 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBP04114 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBP04114 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBP04114 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBP04114 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBP04114 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBP04114 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBP04114 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBP04114 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBP04114 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBP04114 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBP04114 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBP04114 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBP04114 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBP04114 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBP04114 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBP04114 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBP04114 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBP04114 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBP04114 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBP04114 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBP04114 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBP04114 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBP04114 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBP04114 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBP04114 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBP04114 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBP04114 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBP04114 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBP04114 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBP04114 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBP04114 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBP04114 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBP04114 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBP04114 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBP04114 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBP04114 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBP04114 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBP04114 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBP04114 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBP04114 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBP04114 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBP04114 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBP04114 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBP04114 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBP04114 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBP04114 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBP04114 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBP04114 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBP04114 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBP04114 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBP04114 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBP04114 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBP04114 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBP04114 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBP04114 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBP04114 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBP04114 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms