Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLDN7O95471 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN7O95471 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN7O95471 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms