Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms