Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF4AO95239 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF4AO95239 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIF4AO95239 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms