Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLSTN1O94985 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSTN1O94985 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSTN1O94985 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSTN1O94985 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSTN1O94985 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSTN1O94985 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLSTN1O94985 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLSTN1O94985 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLSTN1O94985 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLSTN1O94985 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLSTN1O94985 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLSTN1O94985 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLSTN1O94985 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLSTN1O94985 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLSTN1O94985 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CLSTN1O94985 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLSTN1O94985 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CLSTN1O94985 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CLSTN1O94985 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CLSTN1O94985 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms