Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALDH1A2O94788 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH1A2O94788 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALDH1A2O94788 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALDH1A2O94788 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALDH1A2O94788 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALDH1A2O94788 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALDH1A2O94788 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALDH1A2O94788 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALDH1A2O94788 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH1A2O94788 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH1A2O94788 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH1A2O94788 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALDH1A2O94788 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ALDH1A2O94788 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALDH1A2O94788 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALDH1A2O94788 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALDH1A2O94788 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALDH1A2O94788 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALDH1A2O94788 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms