Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
JRKO75564 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
JRKO75564 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
JRKO75564 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
JRKO75564 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
JRKO75564 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
JRKO75564 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
JRKO75564 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
JRKO75564 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
JRKO75564 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JRKO75564 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JRKO75564 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JRKO75564 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JRKO75564 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JRKO75564 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JRKO75564 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JRKO75564 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
JRKO75564 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
JRKO75564 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
JRKO75564 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JRKO75564 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JRKO75564 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
JRKO75564 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
JRKO75564 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
JRKO75564 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
JRKO75564 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
JRKO75564 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
JRKO75564 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
JRKO75564 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
JRKO75564 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
JRKO75564 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
JRKO75564 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
JRKO75564 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
JRKO75564 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
JRKO75564 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
JRKO75564 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
JRKO75564 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
JRKO75564 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
JRKO75564 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
JRKO75564 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
JRKO75564 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
JRKO75564 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
JRKO75564 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
JRKO75564 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
JRKO75564 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
JRKO75564 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
JRKO75564 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
JRKO75564 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JRKO75564 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
JRKO75564 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JRKO75564 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
JRKO75564 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JRKO75564 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
JRKO75564 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JRKO75564 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JRKO75564 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
JRKO75564 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
JRKO75564 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
JRKO75564 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JRKO75564 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
JRKO75564 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
JRKO75564 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
JRKO75564 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
JRKO75564 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
JRKO75564 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JRKO75564 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JRKO75564 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
JRKO75564 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JRKO75564 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JRKO75564 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JRKO75564 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JRKO75564 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JRKO75564 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JRKO75564 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JRKO75564 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JRKO75564 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JRKO75564 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JRKO75564 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JRKO75564 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JRKO75564 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JRKO75564 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JRKO75564 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
JRKO75564 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
JRKO75564 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
JRKO75564 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JRKO75564 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
JRKO75564 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JRKO75564 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
JRKO75564 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
JRKO75564 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JRKO75564 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
JRKO75564 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
JRKO75564 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JRKO75564 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
JRKO75564 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JRKO75564 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JRKO75564 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JRKO75564 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
JRKO75564 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
JRKO75564 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms