Protein–RNA interactions for Protein: O75509

TNFRSF21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF21O75509 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF21O75509 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF21O75509 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF21O75509 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF21O75509 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms