Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX2O60749 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX2O60749 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX2O60749 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX2O60749 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX2O60749 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX2O60749 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX2O60749 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX2O60749 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX2O60749 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX2O60749 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX2O60749 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX2O60749 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX2O60749 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX2O60749 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX2O60749 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX2O60749 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX2O60749 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX2O60749 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX2O60749 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX2O60749 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX2O60749 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX2O60749 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX2O60749 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX2O60749 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX2O60749 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX2O60749 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX2O60749 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX2O60749 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX2O60749 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX2O60749 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX2O60749 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX2O60749 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX2O60749 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX2O60749 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX2O60749 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX2O60749 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX2O60749 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX2O60749 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX2O60749 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX2O60749 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX2O60749 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX2O60749 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX2O60749 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX2O60749 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNX2O60749 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX2O60749 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX2O60749 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX2O60749 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX2O60749 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX2O60749 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX2O60749 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX2O60749 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX2O60749 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX2O60749 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX2O60749 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX2O60749 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX2O60749 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX2O60749 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX2O60749 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX2O60749 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX2O60749 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX2O60749 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX2O60749 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX2O60749 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX2O60749 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX2O60749 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX2O60749 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX2O60749 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX2O60749 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX2O60749 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX2O60749 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX2O60749 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX2O60749 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX2O60749 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX2O60749 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX2O60749 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX2O60749 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX2O60749 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX2O60749 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX2O60749 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX2O60749 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX2O60749 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX2O60749 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX2O60749 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX2O60749 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX2O60749 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX2O60749 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX2O60749 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX2O60749 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX2O60749 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX2O60749 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX2O60749 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX2O60749 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNX2O60749 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX2O60749 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX2O60749 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX2O60749 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX2O60749 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX2O60749 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms