Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRICKLE3O43900 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRICKLE3O43900 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRICKLE3O43900 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms