Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3O43889 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3O43889 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3O43889 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3O43889 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3O43889 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3O43889 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3O43889 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CREB3O43889 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CREB3O43889 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CREB3O43889 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CREB3O43889 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CREB3O43889 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CREB3O43889 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3O43889 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3O43889 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3O43889 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3O43889 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3O43889 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3O43889 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3O43889 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3O43889 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CREB3O43889 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CREB3O43889 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CREB3O43889 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3O43889 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3O43889 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3O43889 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3O43889 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREB3O43889 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREB3O43889 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREB3O43889 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREB3O43889 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREB3O43889 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREB3O43889 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREB3O43889 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CREB3O43889 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CREB3O43889 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CREB3O43889 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CREB3O43889 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CREB3O43889 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CREB3O43889 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CREB3O43889 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3O43889 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3O43889 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3O43889 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3O43889 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3O43889 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3O43889 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3O43889 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3O43889 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3O43889 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREB3O43889 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREB3O43889 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREB3O43889 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREB3O43889 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREB3O43889 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREB3O43889 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREB3O43889 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREB3O43889 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3O43889 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3O43889 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3O43889 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3O43889 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3O43889 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3O43889 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3O43889 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3O43889 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3O43889 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREB3O43889 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREB3O43889 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREB3O43889 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREB3O43889 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CREB3O43889 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CREB3O43889 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CREB3O43889 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREB3O43889 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREB3O43889 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREB3O43889 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3O43889 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3O43889 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3O43889 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3O43889 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CREB3O43889 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREB3O43889 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREB3O43889 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CREB3O43889 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CREB3O43889 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREB3O43889 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREB3O43889 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREB3O43889 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CREB3O43889 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREB3O43889 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREB3O43889 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREB3O43889 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREB3O43889 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREB3O43889 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREB3O43889 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CREB3O43889 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CREB3O43889 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms