Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC25A20O43772 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC25A20O43772 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A20O43772 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms