Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BUD23O43709 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BUD23O43709 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BUD23O43709 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BUD23O43709 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BUD23O43709 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BUD23O43709 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BUD23O43709 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BUD23O43709 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BUD23O43709 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BUD23O43709 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BUD23O43709 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BUD23O43709 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BUD23O43709 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BUD23O43709 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BUD23O43709 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BUD23O43709 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BUD23O43709 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BUD23O43709 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BUD23O43709 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BUD23O43709 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BUD23O43709 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BUD23O43709 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BUD23O43709 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BUD23O43709 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BUD23O43709 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BUD23O43709 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BUD23O43709 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BUD23O43709 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BUD23O43709 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BUD23O43709 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BUD23O43709 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BUD23O43709 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BUD23O43709 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BUD23O43709 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BUD23O43709 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BUD23O43709 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BUD23O43709 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BUD23O43709 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BUD23O43709 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BUD23O43709 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BUD23O43709 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BUD23O43709 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BUD23O43709 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BUD23O43709 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BUD23O43709 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BUD23O43709 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BUD23O43709 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BUD23O43709 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BUD23O43709 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BUD23O43709 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BUD23O43709 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BUD23O43709 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BUD23O43709 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BUD23O43709 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BUD23O43709 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BUD23O43709 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BUD23O43709 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BUD23O43709 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BUD23O43709 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BUD23O43709 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BUD23O43709 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BUD23O43709 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BUD23O43709 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BUD23O43709 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BUD23O43709 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BUD23O43709 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BUD23O43709 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BUD23O43709 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BUD23O43709 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BUD23O43709 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BUD23O43709 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BUD23O43709 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BUD23O43709 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BUD23O43709 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BUD23O43709 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BUD23O43709 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BUD23O43709 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BUD23O43709 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BUD23O43709 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BUD23O43709 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BUD23O43709 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BUD23O43709 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BUD23O43709 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BUD23O43709 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BUD23O43709 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BUD23O43709 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BUD23O43709 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BUD23O43709 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BUD23O43709 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BUD23O43709 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BUD23O43709 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BUD23O43709 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BUD23O43709 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BUD23O43709 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BUD23O43709 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BUD23O43709 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BUD23O43709 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BUD23O43709 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BUD23O43709 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms