Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP8B1O43520 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8B1O43520 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8B1O43520 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8B1O43520 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8B1O43520 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B1O43520 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B1O43520 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP8B1O43520 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP8B1O43520 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP8B1O43520 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP8B1O43520 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP8B1O43520 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B1O43520 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP8B1O43520 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP8B1O43520 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP8B1O43520 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ATP8B1O43520 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms