Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF4O43474 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF4O43474 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF4O43474 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF4O43474 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF4O43474 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF4O43474 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF4O43474 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLF4O43474 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLF4O43474 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLF4O43474 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLF4O43474 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLF4O43474 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF4O43474 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF4O43474 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF4O43474 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF4O43474 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF4O43474 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF4O43474 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF4O43474 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF4O43474 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF4O43474 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF4O43474 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF4O43474 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLF4O43474 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLF4O43474 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLF4O43474 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KLF4O43474 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLF4O43474 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF4O43474 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF4O43474 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF4O43474 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF4O43474 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF4O43474 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF4O43474 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF4O43474 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF4O43474 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF4O43474 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF4O43474 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF4O43474 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLF4O43474 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF4O43474 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF4O43474 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF4O43474 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF4O43474 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF4O43474 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLF4O43474 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLF4O43474 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLF4O43474 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLF4O43474 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLF4O43474 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF4O43474 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF4O43474 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF4O43474 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF4O43474 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF4O43474 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF4O43474 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF4O43474 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF4O43474 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF4O43474 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF4O43474 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLF4O43474 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLF4O43474 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLF4O43474 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF4O43474 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF4O43474 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF4O43474 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF4O43474 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF4O43474 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF4O43474 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF4O43474 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF4O43474 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF4O43474 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF4O43474 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF4O43474 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF4O43474 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF4O43474 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF4O43474 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF4O43474 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF4O43474 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF4O43474 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF4O43474 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF4O43474 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF4O43474 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF4O43474 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF4O43474 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF4O43474 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF4O43474 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF4O43474 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF4O43474 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF4O43474 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF4O43474 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF4O43474 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF4O43474 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF4O43474 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF4O43474 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF4O43474 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF4O43474 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF4O43474 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF4O43474 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms