Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA5O15230 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA5O15230 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA5O15230 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA5O15230 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms