Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC179H3BU77 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC179H3BU77 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC179H3BU77 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms