Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBASA2RRP1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBASA2RRP1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NBASA2RRP1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.5 ms