Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
A0A1W2PPC1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms