Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AL590560.2-201ENST00000608430 732 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AL117372.1-201ENST00000613711 459 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 SLFN13-211ENST00000542635 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 CCL28-201ENST00000361115 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 DPH3-202ENST00000383775 3052 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 DNAJC27-AS1-205ENST00000434897 4660 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 TTC39A-212ENST00000447632 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ZNF248-208ENST00000611278 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 TDP1-203ENST00000393454 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 PTBP2-202ENST00000370198 3054 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 CLUHP3-206ENST00000562354 4117 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 PRDM11-206ENST00000622142 10730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 LAMA3-207ENST00000587184 5007 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ZNF471-202ENST00000591537 5859 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 GEMIN6-201ENST00000281950 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 PTPRR-203ENST00000378778 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 LINC02418-202ENST00000567788 4592 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 GPR182-201ENST00000300098 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AL590004.4-201ENST00000566733 7060 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 DDX11L16-201ENST00000507418 1306 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ZFP2-205ENST00000523286 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 FO393411.1-201ENST00000325612 420 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AHCYP5-201ENST00000331585 1238 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 MIR425-201ENST00000362162 87 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 SNORA35-201ENST00000386104 128 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AL451048.1-201ENST00000413328 217 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC111200.2-201ENST00000418877 505 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AL590729.1-201ENST00000427046 573 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 EZR-AS1-201ENST00000451712 217 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 DISC1-IT1-201ENST00000456782 762 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC013275.1-202ENST00000457436 501 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 GAPDHP31-201ENST00000509325 1014 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 LINC02517-201ENST00000509453 492 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC091987.1-202ENST00000522464 789 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC109460.4-201ENST00000561471 454 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC125421.2-202ENST00000580776 477 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 JPT1-211ENST00000581874 517 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RN7SL468P-201ENST00000582256 294 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC087645.1-201ENST00000588528 291 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AP003121.1-201ENST00000609845 414 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 FMN2-206ENST00000543681 2902 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ZNF569-202ENST00000392149 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ARMC3-201ENST00000298032 2811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC105342.1-201ENST00000378334 6848 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 BRPF1-206ENST00000457855 4308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ZBTB43-203ENST00000449886 5851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 LCLAT1-201ENST00000309052 5060 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 EPB41-202ENST00000347529 2676 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 DHFR2-202ENST00000394221 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ZNF333-201ENST00000292530 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ARHGAP11A-202ENST00000543522 3152 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 SLC24A1-211ENST00000544319 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ZBTB20-AS1-203ENST00000475939 1687 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 SAG-201ENST00000409110 1591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 DGKG-202ENST00000344484 3445 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ZNF701-201ENST00000301093 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 PBRM1-208ENST00000410007 4905 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 C1orf87-201ENST00000371201 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RAB13-205ENST00000614713 1353 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ZNF778-201ENST00000306502 2386 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms