Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms