Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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BPTFQ12830 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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