Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 COL12A1-201ENST00000322507 11723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 GPNMB-202ENST00000381990 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 OPTN-202ENST00000378747 3400 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 GTF2IP1-202ENST00000614592 2047 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 BBS12-201ENST00000314218 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SLC8A1-209ENST00000408028 2898 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CERS6-AS1-201ENST00000425636 2890 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 TRBV6-1-201ENST00000390353 401 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL513302.1-201ENST00000415679 428 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RPL23AP34-201ENST00000423483 410 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 EIF3IP1-201ENST00000433048 967 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 IFNWP5-201ENST00000445100 588 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC242426.2-201ENST00000446956 795 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 OR9A3P-202ENST00000485185 878 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 NR1I3-233ENST00000515452 1093 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
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MKRN4PQ13434 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
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MKRN4PQ13434 CDHR3-211ENST00000478080 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
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MKRN4PQ13434 CCDC83-202ENST00000342404 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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MKRN4PQ13434 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 KLHL32-205ENST00000539200 3600 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CPM-211ENST00000551568 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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MKRN4PQ13434 TRIM6-203ENST00000380107 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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MKRN4PQ13434 ZNF615-208ENST00000598071 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 DPH3-204ENST00000488423 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 ATP9B-208ENST00000586722 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AL590491.1-201ENST00000611916 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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MKRN4PQ13434 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 IYD-201ENST00000229447 7513 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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MKRN4PQ13434 RNA5SP263-201ENST00000363376 128 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 VTRNA1-2-201ENST00000365241 89 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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MKRN4PQ13434 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 TMEM211-202ENST00000423535 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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MKRN4PQ13434 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 RPSAP53-201ENST00000433498 862 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 RBMY2NP-201ENST00000434454 1028 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 LINC01883-201ENST00000457385 380 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 RN7SL368P-201ENST00000473384 277 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 DAZAP2P1-201ENST00000475212 503 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AC084017.1-201ENST00000483240 860 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AC104164.4-201ENST00000483456 493 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 RN7SL792P-201ENST00000496286 305 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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