Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 KDM5DP1-201ENST00000622542 298 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 FHL5-203ENST00000541107 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC003087.1-201ENST00000412828 499 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC073188.3-201ENST00000425228 339 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.3 ms