Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms