Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARFGEF1Q9Y6D6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGEF1Q9Y6D6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGEF1Q9Y6D6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGEF1Q9Y6D6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGEF1Q9Y6D6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGEF1Q9Y6D6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGEF1Q9Y6D6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGEF1Q9Y6D6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGEF1Q9Y6D6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGEF1Q9Y6D6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGEF1Q9Y6D6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGEF1Q9Y6D6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGEF1Q9Y6D6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGEF1Q9Y6D6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms