Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KNSTRNQ9Y448 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNSTRNQ9Y448 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms