Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms