Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A4

RRP7A, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7AQ9Y3A4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RRP7AQ9Y3A4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP7AQ9Y3A4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms