Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms