Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms