Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms