Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC2Q9Y235 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC2Q9Y235 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms