Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM35Q9UPQ4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
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