Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAF8Q9UPN6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms