Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZMYND8Q9ULU4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms