Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms