Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCAN3Q9UKA8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCAN3Q9UKA8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCAN3Q9UKA8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN3Q9UKA8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms